Керівник апарату суду Герасименко Ірина Євгенівна	Заступник керівника апарату суду Коваленко Людмила Павлівна
Заступник керівника апарату Квятковська Катерина Юріївна

В апараті Шостого апеляційного адміністративного суду функціонує 11 відділів:

Відділ по забезпеченню роботи керівника апарату;

Відділ прийому та надання інформаційних послуг
(інформаційний центр)

Відділ документального забезпечення та контролю (канцелярія);

Відділ забезпечення судового процесу;

Відділ аналітично-статистичної та організаційної роботи;

Відділ правової роботи;

Відділ управління персоналом;

Відділ планово-фінансової діяльності, бухгалтерського обліку та звітності;

Відділ матеріально-технічного та господарського забезпечення;

Відділ інформаційно-технічного забезпечення;

Відділ (служба) судових розпорядників.